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最新研究成果 | 清華大學(xué)藥學(xué)院肖百龍/生命學(xué)院李雪明團(tuán)隊(duì)揭示PIEZO1在脂膜上的張力感受機(jī)制

近期,清華大學(xué)藥學(xué)院肖百龍團(tuán)隊(duì)與生命學(xué)院李雪明團(tuán)隊(duì)合作首次解析了機(jī)械力受體PIEZO1在脂膜環(huán)境中的受力形變過(guò)程,定量了其皮牛尺度的機(jī)械敏感性,建立了其曲率感知理論學(xué)說(shuō),從根本上解答了其將物理機(jī)械刺激轉(zhuǎn)化成生物電信號(hào)這一核心科學(xué)問(wèn)題。

機(jī)械力感知決定我們的日常行為,例如握手、擁抱、親吻、行走、刷手機(jī)、血壓飆升等。力是無(wú)形的,那我們?nèi)梭w如何感知?直到2010年,Ardem Patapoutian教授團(tuán)隊(duì)報(bào)道了一類介導(dǎo)人體機(jī)械力感知的分子受體—PIEZO蛋白,為我們認(rèn)識(shí)了解這一基本的生物學(xué)問(wèn)題帶來(lái)了突破。因?yàn)榘l(fā)現(xiàn)PIEZO并證明其觸覺(jué)受體的功能,Ardem Patapition與David Julius教授(溫度受體發(fā)現(xiàn)者)分享了2021年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)(圖1)。

圖 1 2021諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)委員會(huì)發(fā)布的示意圖總結(jié)了PIEZO的發(fā)現(xiàn)(上半部分)、所介導(dǎo)的觸覺(jué)、本體覺(jué)感知等生理病理功能(下半部分右側(cè))、以及結(jié)構(gòu)模型與機(jī)械力感知假說(shuō)猜想(下半部分左側(cè))。

那么PIEZO蛋白又是如何將物理機(jī)械刺激轉(zhuǎn)化成生物電信號(hào)的呢?肖百龍及其團(tuán)隊(duì)近10年致力于解答這一核心科學(xué)問(wèn)題。其于2012年在Patapoutian課題組從事博士后研究期間首次證實(shí)了PIEZO蛋白是在哺乳動(dòng)物中鑒定發(fā)現(xiàn)的首類機(jī)械門(mén)控陽(yáng)離子通道(Nature 2012);隨后其課題組與合作者在PIEZO的結(jié)構(gòu)功能機(jī)制研究方面取得了一系列重要研究進(jìn)展,幫助推動(dòng)了PIEZO的發(fā)現(xiàn)與研究成為了2021年的諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)研究成果(圖2)。

圖 2 PIEZO的機(jī)械力感知分子機(jī)制研究進(jìn)展總結(jié)。

基于肖百龍與李雪明課題組合作解析的PIEZO家族成員PIEZO1(Nature 2018)與PIEZO2(Nature 2019)的三維結(jié)構(gòu)[MacKinnon以及Patapoutian & Ward課題組也同時(shí)報(bào)導(dǎo)了PIEZO1的結(jié)構(gòu)(eLife 2017; Nature 2018)]以及機(jī)制研究(Neuron 2016; Neuron 2020),研究者們提出了PIEZO的機(jī)械力感知機(jī)制猜想:

PIEZO形成三聚體三葉螺旋槳狀離子通道,中心是負(fù)責(zé)離子通透的孔道部分,外周是三個(gè)負(fù)責(zé)機(jī)械力感知的槳葉部分(圖1及圖3左側(cè))。非常有趣的是,在孔道處于關(guān)閉態(tài),嵌在細(xì)胞膜中的槳葉呈現(xiàn)往細(xì)胞外高度彎曲的狀態(tài),提示其可以彎曲其所在的細(xì)胞膜,形成我們稱之為納米碗(nanobowl)狀的PIEZO-脂膜體系(圖1及圖3右側(cè))。有研究顯示PIEZO1蛋白可以在受力刺激下發(fā)生可逆的形變(Nature 2019)?;谶@些結(jié)構(gòu)功能研究,研究者們提出當(dāng)細(xì)胞膜張力改變時(shí),PIEZO可以從彎曲狀變?yōu)槠秸範(fàn)?,帶?dòng)中間的孔道開(kāi)放,從而將機(jī)械力刺激轉(zhuǎn)化為陽(yáng)離子流通。

圖 3 PIEZO通道的三聚體三葉螺旋槳狀(左側(cè)部分,俯視圖)與納米碗狀(右側(cè)部分,平視圖)三維結(jié)構(gòu)。

但事實(shí)上,在2021年諾獎(jiǎng)?lì)C布時(shí),研究者們還未能解析出PIEZO受力開(kāi)放的結(jié)構(gòu)。膜上PIEZO在受力后是否如諾獎(jiǎng)示意圖中所展示的一樣(圖1),從彎曲的關(guān)閉態(tài)進(jìn)入平展的開(kāi)放態(tài)?這是PIEZO諾獎(jiǎng)研究的未解之謎。

得益于冷凍電鏡在生物大分子結(jié)構(gòu)解析方面的技術(shù)突破,研究者們可以解析出蛋白在靜息、游離狀態(tài)下的結(jié)構(gòu)。但是,生物大分子并不是靠“呆若木雞”的狀態(tài)來(lái)發(fā)揮功能,其千姿百態(tài)的變化才是生命奧妙所在,而這些變化往往取決于其組裝形式、配體結(jié)合和所處的物理狀態(tài)(膜環(huán)境、電勢(shì)能、溫度和力等)。如何在嚴(yán)苛的冷凍樣品狀態(tài)下,引入無(wú)形的膜張力來(lái)獲取PIEZO的不同結(jié)構(gòu)功能狀態(tài)呢?

肖百龍與李雪明指導(dǎo)四位博士生楊旭中、林超、陳旭東、李首卿對(duì)這一極具挑戰(zhàn)的科學(xué)問(wèn)題開(kāi)展研究,借鑒前人把膜蛋白重組進(jìn)脂質(zhì)體中,并用冷凍電鏡解析其結(jié)構(gòu)的技術(shù)(Nature 2009; PNAS 2020),經(jīng)過(guò)反復(fù)嘗試、摸索,最終首次建立了膜上受力結(jié)構(gòu)解析體系(圖 4)。該策略的核心是通過(guò)蛋白與脂質(zhì)體之間的曲率差異(curvature mismatch)來(lái)引入膜張力,這對(duì)PIEZO蛋白尤為適用,因?yàn)镻IEZO的114個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域形成的跨膜區(qū)并不在一個(gè)平面上,而是形成納米碗狀的凹陷結(jié)構(gòu)(圖3)。

圖 4 PIEZO1-脂質(zhì)體冷凍電鏡三維結(jié)構(gòu)解析。

PIEZO1本身的曲率半徑接近10 nm,其主要以outside-in的方式重組到脂質(zhì)體中。在同等大小的脂質(zhì)體中時(shí),曲率相符呈圓形。當(dāng)它重組進(jìn)更大的脂質(zhì)體中時(shí),曲率半徑的差異在兩者間產(chǎn)生力,蛋白和膜發(fā)生形變,呈水滴狀(圖4c)。

而當(dāng)一小部分PIEZO1以outside-out的方式重組到脂質(zhì)體中(圖4b箭頭所示),PIEZO1蛋白與脂質(zhì)體的曲率半徑朝向截然相反,膜與蛋白間產(chǎn)生的的作用力變大,導(dǎo)致PIEZO1蛋白處于受力展平的構(gòu)象狀態(tài)(圖4d)。

研究者們最終得到PIEZO1在膜上契合狀態(tài)(10 nm曲率半徑)和受力展平的兩種結(jié)構(gòu),分別命名為彎曲(Curved)和平展(Flattened)構(gòu)象,佐證了PIEZO1蛋白具備可逆形變和感知脂膜曲率變化的特殊能力(圖5)。

圖 5 PIEZO1的彎曲(左側(cè))和平展?fàn)睿ㄓ覀?cè))三維結(jié)構(gòu)。

通過(guò)比較PIEZO1在脂膜上彎曲和平展的兩種結(jié)構(gòu),研究者們對(duì)PIEZO1感受膜張力后的動(dòng)態(tài)構(gòu)象變化、形變參數(shù)進(jìn)行了定量分析,不僅驗(yàn)證了之前所提出的作用機(jī)制假說(shuō),并定量了PIEZO1的皮牛尺度的機(jī)械敏感性,進(jìn)而建立了其曲率感知理論學(xué)說(shuō)(圖6)。

圖 6 PIEZO1-liposome從彎曲狀到平展?fàn)畹男巫儏?shù)測(cè)量以及機(jī)械敏感性計(jì)算。

?PIEZO1的受力形變:Piezo1在受力展平過(guò)程中,其末端有10 nm的向下位移、所占膜面積擴(kuò)張了300 nm2(圖6a, b)。

?力的感知機(jī)制—曲率形變特性:Scheuring與Mackinnon團(tuán)隊(duì)合作通過(guò)原子力顯微鏡測(cè)得PIEZO1下壓距離和所需力之間存在線性彈性關(guān)系y=7x+22 (Nature 2019)。引用該公式與自由能變化公式(圖6c),10 nm的位移可得出PIEZO1彎曲和平展?fàn)顟B(tài)之間存在570 pN.nm的能量壘。而Nanobowl儲(chǔ)存了高達(dá)300 nm2的膜面積,意味著只需1.9 pN/nm的張力就能實(shí)現(xiàn)570 pN.nm做功,這與電生理測(cè)量值1.4 pN/nm接近(eLife 2015)。

?力的傳導(dǎo)機(jī)制—納米杠桿原理:力從外周傳遞到中央孔道區(qū)。在展平過(guò)程中,胞內(nèi)Beam長(zhǎng)桿在接近中心孔道模塊區(qū)形成kink,符合之前提出的該位點(diǎn)承擔(dān)支點(diǎn)的功能推測(cè)(圖7)?;谑×Ω軛U原理,Beam不僅具有力的傳遞與放大功能,且具有形變緩沖作用,使長(zhǎng)臂末端3 nm的形變縮小到短臂端1 nm的形變,使其既能控制中央孔道區(qū)的門(mén)控,又不導(dǎo)致其過(guò)度的擴(kuò)張,從而維持PIEZO通道的陽(yáng)離子選擇性通透能力。

圖 7 PIEZO1的納米杠桿傳遞機(jī)制。

?力的門(mén)控機(jī)制—帽子運(yùn)動(dòng),跨膜疏水門(mén)打開(kāi):PIEZO1受力展平時(shí),使得胞外帽子與槳葉之間的相互作用被打破,帽子發(fā)生順時(shí)針旋轉(zhuǎn),下方的跨膜孔道區(qū)發(fā)生擴(kuò)張。與PIEZO2(灰色)緊閉的跨膜區(qū)疏水門(mén)相比,PIEZO1 展平狀態(tài)的結(jié)構(gòu)呈現(xiàn)10埃的擴(kuò)張(圖8)。

圖 8 PIEZO1的帽子-跨膜疏水門(mén)孔機(jī)制。

綜上,研究者們總結(jié)出PIEZO通道的受力形變與門(mén)控機(jī)制(圖9)。

?在靜息狀態(tài)時(shí),PIEZO1使脂膜發(fā)生彎曲,形成碗表面積為628nm2、投影面積為314nm2的納米碗系統(tǒng),PIEZO1與脂膜處于平衡。

?膜張力改變時(shí),平衡被打破,膜帶動(dòng)著PIEZO1蛋白一起展平。

?展平的槳葉帶動(dòng)胞內(nèi)側(cè)的Beam發(fā)生杠桿運(yùn)動(dòng),把形變傳遞到孔道區(qū)胞內(nèi)側(cè),可能通過(guò)門(mén)閂-拴鎖機(jī)制,打開(kāi)三個(gè)側(cè)向出口閘門(mén)(Lateral plug gate),讓離子流入細(xì)胞 。

?展平的槳葉使其與帽子之間的相互作用被打破,帽子的旋轉(zhuǎn)運(yùn)動(dòng),加上槳葉的展平運(yùn)動(dòng),共同使得孔道區(qū)上半段的疏水閥門(mén)打開(kāi),離子則由帽子下的空隙,側(cè)向進(jìn)入孔道。

圖 9 PIEZO1的受力形變與門(mén)控機(jī)制模式圖。

總結(jié)而言,本研究首次實(shí)現(xiàn)了對(duì)機(jī)械力受體PIEZO1通道在脂膜上受力狀態(tài)下的動(dòng)態(tài)結(jié)構(gòu)解析,揭示了其受力形變與脂膜曲率感知的特性,定量了其皮牛尺度的機(jī)械敏感性,建立了其曲率感知理論學(xué)說(shuō),從根本上解答了其將物理機(jī)械刺激轉(zhuǎn)化成生物電信號(hào)這一PIEZO諾獎(jiǎng)研究的未解之謎。無(wú)形的力在物理上可被定義為受力對(duì)象的形變。而PIEZO正是利用其納米尺度的曲率形變?nèi)ヌ綔y(cè)皮牛尺度的力,從而成為一類低能耗的超敏機(jī)械力感受器,不由讓研究者們驚嘆生命過(guò)程與物理原理的交匯之美!

以上論文于2022年4月6日在《自然》期刊在線刊登,標(biāo)題為《PIEZO1在脂膜中的結(jié)構(gòu)形變與曲率感知》(Structure deformation and curvature sensing of PIEZO1 in lipid membranes)。

肖百龍教授、李雪明研究員為本論文的共同通訊作者,博士研究生楊旭中、林超、陳旭東、李首卿為共同第一作者。該研究得到了國(guó)家科技部“2030科技創(chuàng)新-腦計(jì)劃與類腦計(jì)劃”重大研究項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金委杰青項(xiàng)目以及重點(diǎn)項(xiàng)目、清華-北大生命科學(xué)聯(lián)合中心、膜生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、高精尖結(jié)構(gòu)生物學(xué)中心、生物結(jié)構(gòu)前沿研究中心的項(xiàng)目經(jīng)費(fèi)支持。感謝清華大學(xué)冷凍電鏡平臺(tái)和蛋白質(zhì)制備與鑒定平臺(tái);王宏偉教授團(tuán)隊(duì)劉楠、徐潔提供石墨烯載網(wǎng);閆創(chuàng)業(yè)研究員團(tuán)隊(duì)分享deep-2D腳本;張馨予、趙天放開(kāi)發(fā)EPicker軟件;以及王莉、周珩、姚霞、范瀟、雷建林、李曉敏博士給予技術(shù)上的幫助。

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